Ngày 30 tháng 8 năm 2015, Coman được Juventus cho mượn đến Bayern München với phí mượn 7 triệu € trong hai năm thanh toán trong hai đợt và có thể mua đứt với giá 21 triệu € sau khi thời hạn cho mượn chấm dứt. Tại Bayern anh khoác áo số 29.
Một phát biểu trên trang web chính thức của Bayern, GĐTT Matthias Sammer đã đưa ra tuyên bố: "Chúng tôi rất vui mừng khi có được chữ ký của Coman. Coman hiện đang là một trong những tài năng trẻ sáng giá nhất bóng đá châu Âu. Cậu ấy rất nhanh, kỹ thuật và có thể chơi tốt ở vị trí tiền vệ tấn công hoặc tiền đạo. Tôi cho rằng, Bayern sẽ được hưởng lợi rất nhiều từ sự có mặt của Coman". Vậy là Coman đã là cầu thủ thứ 2 của Juve gia nhập Bayern trong Hè 2015.
 |
| Kingsley Coman ra mắt Bayern Munich |
Coman có trận đấu đầu tiên cho “Hùm xám” vào ngày 12 tháng 9 khi vào sân thay cho Arturo Vidal ở phút 56 trận thắng 2-1 trước FC Augsburg tại Bundesliga. Năm ngày sau tại UEFA Champions League cho Bayern, anh có trận đấu đầu tiên và có một đường chuyền thành bàn cũng như đem về quả phạt đền giúp đội bóng nước Đức giành chiến thắng 3-0 trước Olympiakos. Ngày 19 tháng 9, anh có bàn thắng đầu tiên trên đất Đức trong chiến thắng 3-0 trước Darmstadt 98 ở lần đầu tiên đá chính cho Bayern. Một tuần sau đó, anh tiếp tục lập công trong trận đấu có tỷ số tương tự với Mainz 05.
 |
| Kingsley Coman(bên phải) |
Ngày 24 tháng 11, trong trận thắng 4-0 trước Olympiakos, Coman có bàn thắng đầu tiên tại Champions League. Chỉ trong thời gian ngăn có bốn ngày, anh ghi bàn ấn định chiến thắng 2-0 trước Hertha BSC tại Bundesliga. Ngày 19 tháng 12, anh về nhì trong cuộc bầu chọn cầu thủ dưới 21 tuổi xuất sắc nhất đang thi đấu tại Châu Âu (Golden Boy) sau người đồng hương Anthony Martial.
Trong tháng 2/2016, trận đấu cuối cùng của Bayern tại Bundesliga, Coman mở tỉ số giúp đội bóng của mình đánh bại VfL Wolfsburg 2–0. Ngày 12 tháng 3, Coman có ba đường chuyền thành bàn trong chiến thắng 5–0 trước Werder Bremen. Bốn ngày sau đó, trong trận đấu lượt về vòng 1/16 giữa Bayern và đội bóng chủ quản của anh là Juventus, khi tỷ số trận đấu đang là 2-0 nghiêng về đội bóng Ý, Coman được tung vào sân thay cho Xabi Alonso. Anh chính là người đã kiến tạo cho Thomas Müller gỡ hòa 2-2 ở phút 91 và tự mình ghi bàn ấn định chiến thắng 4-2 ở hiệp phụ để đưa Bayern vào tứ kết.
 |
| Kingsley Coman trong màu áo Bayern |
Trong trận chung kết Cúp bóng đá Đức (DFB-Pokal) năm 2016 với Borussia Dortmund trận đấu mà chung cuộc Bayern đã giành chức vô địch sau loạt sút luân lưu , Coman cũng được vào sân từ ghế dự bị ở phút 108. Đây là danh hiệu vô địch thứ tám mà anh giành được khi chưa đầy 20 tuổi, trong đó có ba chức vô địch quốc gia Pháp, Ý và Đức. Ngày 24 tháng 10 năm 2016, Coman lần thứ hai liên tiếp về nhì trong cuộc bầu chọn cho danh hiệu Golden Boy, lần này là sau người động đội tại Bayern Renato Sanches.
Ngày 25 tháng 2 năm 2017, trong trận thắng hủy diệt 8-0 trước Hamburg tại Bundesliga Coman đã lập cho mình cú đúp chỉ trong vòng 4 phút . Ngày 27 tháng 4, Bayern chính thức kích hoạt điều khoản mua đứt Coman từ Juventus và Coman sẽ gắn bó với đội bóng nước Đức theo bản hợp đồng mới có thời hạn đến năm 2020.
